Незаданные вопросы в биологии больших данных



Скачать 60.61 Kb.
Дата02.06.2016
Размер60.61 Kb.
c:\users\serguei\downloads\logo-msu.pngc:\users\serguei\downloads\logo-ippi.jpgc:\users\serguei\downloads\logo_hse.pngмфти (гу)c:\users\serguei\downloads\logocnrs.png

Незаданные вопросы в биологии больших данных

(big data in biology)
23 марта 2016 года в МФТИ

Затравочные сюжеты для обсуждения

1. Егор Васецкий (Villejuif)

Вводное слово: зачем мы собрались? (10 мин)
2. Григорий Кучеров (Universite Marne la Vallee)

Massive metagenomic classification (10 мин)
3. Валентина Боева (INSERM)

Проблемы «очистки» сигнала, происходящего из смеси раковых и нормальных клеток для данных секвенирования генома, транскриптома и эпигенома (10 мин)
4. Анна Полесская (BIOC, Ecole Polytechnique)

РНК-связывающие белки, микроРНК и регуляция экспрессии генов (10 мин)
5. Андрей Миронов (ФББ МГУ, ИППИ РАН)

Stereogene - быстрый метод поиска корреляций геномных разметок (10 мин)
6. Евгений Шеваль (НИИ физико-химической биологии им. Белозерского МГУ)

Механизмы биогенеза клеточных структур (10 мин)


7. Сергей Нечаев (LPTMS Orsay, лаборатория Понселе, ФИАН РАН)

Некоторые статистические вопросы в анализе больших массивов: а) роль шума в редких событиях, б) ультраметрика больших данных, в) поиск корреляций с помощью анализа «дистантных» матриц (10 мин)


8. Александр Чертович (Физически факультет МГУ)

Способы восстановления трехмерных конформаций из хромосомных контактных карт (10 мин)


9. Алексей Драль (AMAZON, АТП ФИВТ МФТИ)

(*) TBA (10 мин)


10. Всеволод Макеев (Институт общей генетики РАН им. Н.И. Вавилова)

Автоматические и ручное управление при работе с большими данными. Опыт анализа ДНК-белковых взаимодействий (10 мин)


Подтвердили участие:


  1. Григорий Кучеров - gregory.kucherov@univ-mlv.fr,

Universite Marne la Vallee, France



  1. Валентина Боева - valentina.boeva@inserm.fr,

INSERM, France



  1. Анна Полесская - anna.polesskaya@cea.fr,

BIOC, Ecole Polytechnique, Palaiseau, France

РНК-связывающие белки, микроРНК и регуляция экспрессии генов




  1. Егор Васецкий - vassetzky@gmail.com,

Villejuif, France



  1. Сергей Нечаев - sergei.nechaev@gmail.com,

Orsay, France, лаборатория Понселе, Москва


  1. Евгений Шеваль, evsheval@gmeil.com,

НИИ физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского МГУ

Механизмы биогенеза клеточных структур




  1. Михаил Рубцов, ma_rubtsov@mail.ru,

Кафедра молекулярной биологии МГУ имени М.В.Ломоносова


  1. Андрей Александрович Миронов, mironov@bioinf.fbb.msu.ru,

ФББ МГУ, ИППИ РАН

Stereogene - быстрыей метод поиска корреляций геномных разметок


  1. Всеволод Юрьевич Макеев, vsevolod.makeev@gmail.com, vsevolod.makeev@vigg.ru,

Институт общей генетики РАН им. Н.И. Вавилова

Автоматические и ручное курирование данных при работе с большими данными. Опыт анализа ДНК-белковых взаимодействий (совм. с Кулаковским И.В.)




  1. Юрий Владимирович Максимов, yurymaximov@gmail.com,

Институт проблем Передачи Информации РАН + Высшая Школа Экономики, Московский Физико-Технический Институт


  1. Антон Бормисов, bormisov@gmail.com,

Индивидуальный предприниматель


  1. Евгений Бурнаев, burnaevevgeny@gmail.com, burnaev@iitp.ru,

Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН, зав. лаб. интеллектуального анализа данных и предсказательного моделирования


  1. Яна Мусинова Musinova.yana@gmail.com,

НИИ физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского МГУ


  1. Захарова Влада Вячеславовна t-vlada@mail.ru,

МГУ им. Ломоносова. Факультет Биоинженерии и Биоинформатики


  1. Алексей Александрович Гаврилов aleksey.gavrilov@mail.ru,

Институт биологии гена РАН (к.б.н., с.н.с., зав. группы Пространственной организации генома)


  1. Андрей Замятнин, zamyat@genebee.msu.ru,

НИИ молекулярной медицины, Первый МГМУ им. И.М. Сеченова


  1. Андрей Зиновьевич Дашевский, dashevskii@gmail.com,

ООО "Кей Лаб"


  1. Михаил Сергеевич Гельфанд, milhail.gelfand@gmail.com,

ИППИ РАН

Сравнительная геномика, транскриптомика, пространственная структура хроматина, эпигеномика




  1. Александр Чертович, chertov@polly.phys.msu.ru,

МГУ, физфак

обзор по способам восстановления трехмерных конформаций из контактных карт




  1. Сергей Владимирович Ульянов, sergey.v.ulyanov@gmail.com,

Лаборатория Структурно-Функциональной Организации Хромосом (Институт Биологии Гена РАН), кафедра молекулярной биологии Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова


  1. Ольга Вальба, valbaolga@gmail.com,

Департамент прикладной математики МИЭМ, НИУ Высшая школа экономики


  1. Михаил Владимирович Тамм, thumm.m@gmail.com,

кафедра физики полимеров и кристаллов, физфак МГУ и департамент прикладной математики МИЭМ ВШЭ


  1. Денис Горев, eveleech@gmail.com,

AT-Consulting


  1. Алексей Драль, aadral@gmail.com,

ассистент кафедры АТП ФИВТ МФТИ, 5 лет индустриального опыта руководства и участия в проектах по интеллектуальной обработке больших данных (AWS Amazon, Yandex, Rambler).


  1. Андрей Ландо, dronte.l@gmail.com,

Институт общей генетики РАН им. Н.И. Вавилова, кафедра Алгритмов и Технологий Программирования ФИВТ МФТИ


  1. Евгений Баулин, baulin@lpm.org.ru,

Аспирант, Институт математических проблем биологии РАН, Пущино


  1. Алексей Михайлович Куликов, amkulikov@gmail.com,

Институт биологии развития РАН


  1. Александр Фокин, bifurc8@gmail.com,

Институт биологии развития РАН


  1. Максим Иванков, maxim.ivankov@gmail.com,

Институт биологии развития РАН

  1. Дмитрий Сорокин

(биоинфоматика)

Поделитесь с Вашими друзьями:


База данных защищена авторским правом ©psihdocs.ru 2017
обратиться к администрации

    Главная страница