Математическое моделирование метаболизма l-валина


Не растет на ксилозе, арабинозе, лактозе, раффинозе. - Растет при температуре



страница2/3
Дата20.07.2022
Размер1,81 Mb.
#187547
1   2   3
Связанные:
2022 04 14 Математическое моделирование метаболизма L-валина

Не растет на ксилозе, арабинозе, лактозе, раффинозе.
- Растет при температуре 24-40 °C
- Растет на средах с pH от 6 до 8,5
- Имеется возможность использовать в качестве субстрата несколько источников углерода (ко-утилизация с глюкозой ацетата, фруктозы)
- Для роста и продукции аминокислот клеткам, кроме углерода, необходимы азот и сера.
небольшие, неподвижные грамположительные бактерии, средой обитания которых является почва.
Является факультативно-анаэробной бактерией, но высокой плотности достигает при аэробном культивировании
Front. Microbiol., 15 November 2021 https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.750206
Субстраты:
В качестве единственных источников углерода в данной модели были протестированы глюкоза, фруктоза, сахароза, рибоза, глюконат, пируват, ацетат, лактат и пропионат.
Все эти соединения могут служить единственным источниками углерода в аэробных условиях. В анаэробных условиях источниками углерода служат глюкоза, фруктоза, сахароза и рибоза.
High-Quality Genome-Scale Reconstruction of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
Название модели :iCGB21FR
Данная модель совмещает в себе полученные раннее модели и расширяет, за счет включения более широкого метаболического охвата. Эти модели:
-iKK446 (Kjeldsen and Nielsen, 2009
-iEZ482 (Zelle et al., 2015)
-iCW773 (Zhang et al., 2017)

Реакции с L-валином в модели iCGB21FR


Фрагмент метаболического пути L-валина Визуализация выполнена в онлайн визуализаторе Escher.
VALabc:
atp_c + h2o_c + val__L_e --> adp_c + h_c + pi_c + val__L_c
VALt2r:
h_e + val__L_e <=> h_c + val__L_c
VALabcpp:
atp_c + h2o_c + val__L_p --> adp_c + h_c + pi_c + val__L_c
VALt2rpp:
h_p + val__L_p <=> h_c + val__L_c
VALTA:
akg_c + val__L_c <=> 3mob_c + glu__L_c
Секрекция валина:
EX_val__L_c
Реакция роста
Глутамат


Поделитесь с Вашими друзьями:
1   2   3




База данных защищена авторским правом ©psihdocs.ru 2022
обратиться к администрации

    Главная страница