Математическое моделирование метаболизма l-валина



страница1/3
Дата20.07.2022
Размер1,81 Mb.
#187547
  1   2   3
Связанные:
2022 04 14 Математическое моделирование метаболизма L-валина


Математическое моделирование метаболизма L-валина
Трофимова Мария, НГУ
Работа выполнена в секторе компьютерного анализа и моделирования биологических систем ИЦиГ СО РАН
-оптимизация метаболизма для увеличение выхода продукта
-проектирование штаммов-продуцентов
-потребление альтернативных субстратов
Актуальность работы
Основные задачи биотехнологии:
Производство и торговля аминокислотами являются одним из наиболее динамичных секторов мирового кормового рынка. Объем рынка аминокислот в России в 2018 г. составил $ 246 712,1 тыс.
L-валин это незаменимая аминокислота, обладающая фармацевтической, косметической и пищевой ценностью.
В моей работе в качестве объекта исследования выступает метаболизм L-валина бактерии Corynebacterium glutamicum - часто используемой в биохимическом производстве.
Лечение бессонницы и нервозности
Применение
L-валина
Укрепляющее действие на мускулатуру
Улучшение корма животных
Восстановление
иммунной системы
Ингредиент препаратов для лечения заболеваний печени
Цель работы
исследование метаболизма L-валина в бактерии Corynebacterium glutamicum методами компьютерного и математического моделирования. 
Задачи
-анализ литературы по выявлению ключевых аспектов метаболизма бактерии Corynebacterium glutamicum и существующих математических моделей;
-построение структурной модели метаболических путей L-валина.
Материалы и методы
  • Язык программирования Python (https://www.python.org/).
  • Среда программирования Jupyter (https://jupyter.org/).
  • Для визуализации используется онлайн визуализатор Escher (https://escher.github.io/#/).
  • В ходе решения задачи оптимизации используется библиотека corbaPy (https://opencobra.github.io/cobrapy/), библиотека Pandas (https://pandas.pydata.org/).

Corynebacterium glutamicum
- Не является патогенным, не образует спор .
- Геном относительно стабилен.
- Быстро растет и не выделяет внеклеточные протеазы
- Возможно использовать для биоремедиации
https://www.researchgate.net/figure/Corynebacterium-glutamicum-showing-the-characteristic-cell-division_fig1_258225582
- Растет на глюкозе, сахарозе, мальтозе, фруктозе, маннозе, этаноле,рибозе.


Поделитесь с Вашими друзьями:
  1   2   3




База данных защищена авторским правом ©psihdocs.ru 2022
обратиться к администрации

    Главная страница